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中国科学院上海免疫与感染研究所晁彦杰研究组发现非编码RNA控制高毒力超级细菌感染致病（图）
晁彦杰 编码 细菌感染 细胞
2024/8/15
2024年8月13日，国际学术期刊Nature Communications在线发表了中国科学院上海免疫与感染研究所晁彦杰研究组的研究论文：RNA interactome of hypervirulent Klebsiella pneumoniae reveals a small RNA inhibitor of capsular mucoviscosity and virulence...
2024年7月31日，国际学术期刊Cardiovascular Research在线发表了中国科学院上海营养与健康研究所杨黄恬研究员与海军军医大学第二附属医院（上海长征医院）王志农教授合作的研究论文"CircCHSY1 protects hearts against ischemia/reperfusion injury by enhancing heme oxygenase 1 expressi...
中国科学院科学家开发逆转座子基因工程新技术 实现全RNA介导的基因精准写入（图）
基因工程 细胞 免疫
2024/7/19
基因组DNA是生命的蓝图，对基因组DNA实现任意尺度的精准操作代表对生命蓝图进行修改绘制的底层能力，是基因工程技术发展的核心。以CRISPR基因编辑技术为代表的技术进步实现了基因组单碱基和短序列尺度的精准编辑，基本解决了基因组精准编辑的挑战。然而，如何针对应用场景的需求，实现大片段DNA在基因组的高效精准整合，仍然是整个基因工程领域亟需突破的难题。该技术的突破意味着可以通过外源功能基因的精准写入来...
2024年6月4日，《分子细胞》（Molecular Cell）在线发表了中国科学院分子细胞科学卓越创新中心陈玲玲研究组关于环形RNA转运与功能研究的最新进展。该研究发现一类腺苷酸富集【Adenosine-rich，(A)-rich】的环形RNA在人源胚胎干细胞H9的细胞核中滞留，并随着定向分化为前脑神经元的过程出核。该工作解析了这一环形RNA转运调控的分子机理，揭示其动态定位参与调控H9细胞中的...
中国科学院分子细胞科学卓越创新中心(生物化学与细胞生物学研究所)陈玲玲研究员受邀在Cell Stem Cell发表核内RNA稳态协调细胞功能相关专评（图）
陈玲玲 细胞 分析 代谢
2024/5/24
2024年5月2日，中国科学院分子细胞科学卓越创新中心（生物化学与细胞生物学研究所）陈玲玲研究员受邀在国际学术期刊Cell Stem Cell上发表了题为“Unveiling the Mystery of Nuclear RNA Homeostasis”的评论文章，对同期发表在该期刊上题为“Nuclear RNA homeostasis promotes systems-level coordin...
Nature Biotechnology|中国科学院分子细胞科学卓越创新中心陈玲玲组实现环形RNA适配体在银屑病小鼠模型中的干预治疗（图）
Nature Biotechnology 陈玲玲 环形RNA 银屑病 干预治疗 Nature Biotechnology
2024/5/9
2024年4月23日，国际学术期刊Nature Biotechnology在线发表了中国科学院分子细胞科学卓越创新中心（生物化学与细胞生物学研究所）陈玲玲研究组关于环形RNA的最新研究进展：“Therapeutic application of circular RNA aptamers in a mouse model of psoriasis”。该研究通过优化RNA自剪接成环的新方法，可大规模...
2024年4月13日，国际学术期刊Nucleic Acids Research在线发表了中国科学院分子细胞科学卓越创新中心（生物化学与细胞生物学研究所）周小龙研究组最新研究成果“Activity reconstitution of Kre33 and Tan1 reveals a molecular ruler mechanism in eukaryotic tRNA acetylation”。该...
2024年3月20日，中国科学院大连化学物理研究所生物技术研究部分子探针与荧光成像研究组（1818组）乔庆龙副研究员和徐兆超研究员团队发展了能够与RNA特异性可逆结合，在活细胞内对细胞核核仁稳定成像的“缓冲荧光探针”Nu-AN，实现了对核仁动态轮廓的成像，并通过活细胞内药物诱导下核仁特定形态的可视化，为核仁应激试剂的筛选提供可视化的工具。
中国科学院科学家研发出单细胞和空间转录组中环形RNA深度学习算法（图）
细胞 空间 学习算法
2024/2/22
环形RNA是一类广泛表达的非编码RNA，有较高的细胞类型及组织表达特异性，在器官发育及肿瘤发生等过程中起着重要调控作用。环形RNA由3‘端的受体位点和5’端的供体位点共价连接形成，这一过程被称为反向剪接，然而由于缺少poly(A)尾，环形RNA无法被经过polyA富集等转录组建库方式有效捕获。因此，环形RNA的表达信息在绝大部分单细胞以及空间转录组数据中缺失。为了获得丰富的单细胞及空间水平的环形R...
前沿丨南京农业大学人工智能学院计智伟课题组提出单细胞RNA-seq聚类新方法（图）
单细胞 RNA-seq 聚类分析 计算框架
2023/11/29
2023年10月3日，生物学领域重要期刊Life Science Alliance在线发表了南京农业大学人工智能学院计智伟教授课题组的题为“scFseCluster: A Feature Selection Enhanced Clustering for Single Cell RNA-seq Data”的研究论文。针对同类算法普遍存在的泛化性能差或计算开销大等局限，他们开发了一种特征选择优化的单...
中国科学院微生物所揭示CRISPR护卫RNA的全新生理功能（图）
生理功能 细胞宿主 微生物
2023/9/19
2023年9月1日，中国科学院微生物研究所李明和向华团队合作在《细胞宿主与微生物》（Cell Host & Microbe）上，发表了题为广泛基于RNA的cas调节监测crRNA丰度和抗CRISPR蛋白的研究文章。该研究揭示了CRISPR护卫RNA的全新生理功能。
2023年5月30日，国际学术期刊Nature Communications在线发表了中科院分子植物科学卓越创新中心/中科院合成生物学重点实验室张余研究组为“A cryo-EM structure of KTF1-bound polymerase V transcription elongation complex”的研究论文。该研究报导了包含KTF1的RNA聚合酶V（RNA polymerase...
中华人民共和国科学技术部科学家开发时空转录组学并在亚细胞水平揭示RNA动力学图谱
细胞 动力学 空间数据
2024/9/10
细胞转录组的时空调节对细胞内蛋白质的正常表达及细胞功能至关重要。然而，由于现有转录组学方法不能同时获得时间和空间数据。美国麻省理工学院研究团队开发了时空转录组测序技术，并应用于探究RNA的生成、转运和降解速率，在亚细胞水平揭示RNA的动力学图谱。该研究成果于2023年5月12日发表在《Nature Methods》上，题为：Spatiotemporally resolved transcripto...
中国科学院分子细胞卓越中心发现核仁新结构调控核糖体RNA末端加工机制（图）
分子细胞 核糖体RNA 生物化学
2023/3/14
2023年3月9日，中国科学院分子细胞科学卓越创新中心（生物化学与细胞生物学研究所）陈玲玲研究组在《自然》（Nature）上，在线发表了题为Nucleolar URB1 ensures 3' ETS rRNA removal to prevent exosome surveillance的研究论文。该工作利用高分辨率活细胞显微成像技术，通过筛选200个核仁候选蛋白质发现12个在纤维中心/致密纤维组...
