搜索结果: 1-15 共查到“农学 CAPs”相关记录15条 . 查询时间(0.078 秒)
基于西瓜全基因组重测序数据,挖掘SNP位点并将其转变为CAPS标记,构建遗传连锁图谱,对西瓜果实与种子相关性状进行QTL分析,为西瓜果实与种子相关性状主效基因精细定位及克隆奠定理论基础。【方法】以普通栽培西瓜品系(Citrullus lanatus ssp. vulgaris)‘W1-1’和黏籽西瓜品系(Citrullus lanatus ssp. mucosospermus)‘PI186490’...
葡萄SNP 标记的CAPS 和TSP 分析
葡萄 单核苷酸多态性 酶切扩增多态性序列 温度转变PCR
2013/11/30
为了建立起葡萄SNP 标记分析的一般方法和探索EST-SNP 标记在葡萄中的应用,对前期开发的葡萄EST-SNP 位点进行了筛选,设计了28 对CAPS(cleaved amplified polymorphic sequences,酶切扩增多态性序列)标记引物和22 对TSP(Temperature-switch PCR,温度转变PCR)标记引物,并在31份葡萄材料中进行了分析,其中20 对CA...
根据不同长度或不同碱基序列的DNA 片段的熔解温度(Tm)不同的原理,将酶切扩增多态性序列(cleaved amplified polymorphic sequence,CAPS)与熔解曲线(melting curve,MC)技术相结合,建立了CAPS-MC 技术,从而实现SNP 分子标记基因分型。通过菜薹‘L58’和紫菜薹‘ZCT095’的基因组重测序数据与白菜基因组的参考序列(‘Chiifu-...
柑橘CAPS标记和AS-PCR引物的开发
柑橘 表达序列标签 单核苷酸多态性
2012/10/17
以从GenBank中下载的93 955条甜橙[Citrus sinensis(L.)Osbeck]EST序列为源序列,利用QualitySNP软件包从中挖掘出1 521个单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism,SNP)候选位点。进一步利用酶切位点查找软件WatCut进行分析,发现其中125个SNP为酶切扩增多态性序列(cleaved amplified pol...
利用CAPS标记推测花生品种(系) FAD2位点基因型的研究
花生 高油酸 CAPS标记
2013/9/5
以5个高油酸含量花生品种(系)和2个普通油酸含量花生品种为试材,利用CAPS标记对这些品种(系)的FAD2位点基因型进行分析。结果表明:5个高油酸含量花生品种(系)的油酸含量均在80%以上,普通油酸含量品种花育22号和花育28号油酸含量分别为51.62%和41.38%。基于CAPS标记在7个品种(系)中的扩增产物及酶切带型分析推测,AhFAD2A位点花育28号为野生型,其他6个品种(系)符合448...
Development of CAPS marker for identifi cation of rym4 and rym5 alleles conferring resistance to the Barley Yellow Mosaic Virus complex in barley
barley marker-assisted breeding mosaic virus complex resistance rym allele identification
2014/3/10
In barley, soil-borne viruses of the barley mosaic virus complex (BaYMV, BaMMV, BaYMV-2) are of high importance due to their increased spread, yield losses, and the fact that protection with chemicals...
采用生物信息学方法将大豆EST序列联配到大豆基因组序列上,挖掘到大豆EST-SNP位点537个。对其靶向基因进行功能注释分析,发现它们主要参与亚细胞定位、蛋白质结合与催化以及代谢等与大豆重要农艺性状形成相关的生物过程。同时开发了简便易行的SNP检测方法,利用EMBOSS软件筛选导致酶切位点改变的EST-SNP,分别以大豆绥农14、合丰25、Acher、Evans、Peking、PI209332、固...
为了开发大豆基因靶向的功能分子标记,本研究采用生物信息学方法分析了大豆基因重测序数据,筛选出酶切位点突变的SNP位点,设计PCR引物163对,选用东北地区主栽品种绥农14的DNA为模板进行PCR扩增,其中139对引物获得大小为400~1 200 bp的特异片段。以大豆绥农14、合丰25、Acher、Evans、Peking、PI209332、固新野生大豆、科丰1号和南农1138-2的DNA为模板,...
芸薹种作物抽薹相关基因BrFLC1的CAPS标记
芸薹种作物 抽薹
2009/8/5
以16份芸薹种作物DH系为试材,通过人工春化处理对其抽薹性状进行了鉴定,明确了材料间抽薹早晚存在显著差异;根据BrFLC1基因序列设计引物进行PCR扩增发现,所有16份材料均获得980 bp的片段。多序列比对与抽薹性的关联分析发现,材料的抽薹早晚与扩增片段的碱基变异相关联,并发现关联位点的碱基变异为限制性内切酶Mva I的识别位点;利用该酶对PCR产物酶切可以将材料明显区分开来,从而建立了BrFL...
Labor-saving Effects of Simultaneous Gibberellin Treatment to Induce Seedlessness and Removal of Caps from Flowers Using a New Tool during Viticulture
brush cup full bloom stage gray mold
2009/7/6
In grapes, caps stuck to flower clusters can become a source of infection with gray mold disease. Thus, it is generally recommended that such caps are removed. We designed a new tool to remove the cap...
【目的】将野生多毛番茄中的高产基因渗入到普通番茄骨干亲本以创造高产番茄育种材料。【方法】TA1229是野生多毛番茄(Lycopersicon hirsutum acc.)LA1777的一个近等基因系,带有来源于LA1777的高产基因(QTL)。通过杂交、回交和分子标记辅助选择方法对TA1229×9706的BC1群体进行遗传分析。【结果】获得23个比TA1229含有的外源染色体片段更短的渐渗系,...
以综合性状好但对黑尾叶蝉 (NephotettixcincticepsUhler)敏感的品种台中 6 5作为轮回亲本 ,与抗性品种DV85连续回交 ,得到回交高代BC6F2 群体 ,进行抗叶蝉性状的回交转育。将抗黑尾叶蝉基因Grh2两侧的RFLP标记C189和G14 6 5成功地转换为在亲本间具有多态的CAPS标记。在进行表型选择的同时 ,利用CAPS标记对BC6F2 进行了标记辅助选择 ,分析了...
摘要选取大麦1H染色体的STS标记MWG913特异性扩增小麦,把得到的片段进行克隆。用Taq酶切分类并测序,把得到的序列同大麦的序列进行比较.依据比较结果,选取对大麦特异的内切酶,用该酶来酶切大麦、小麦、黑麦、长穗偃麦草、中间偃麦草、簇毛麦的MWG913扩增产物,获得对大麦1H染色体特异的CAPs标记。同时,依据酶切位点碱基的差异设计引物对扩增的产物进行第二次扩增,得到该位点的一对染色体特异性AS...
摘要选取家蚕attacin和alpha-amylase基因序列,设计特异性引物,在家蚕品系P50、C108和子一代 (F1) 中扩增。分别采用4种不同的限制性内切酶对扩增产物酶切,最后每个基因都获得了一个CAPs分子标记。依据所得的两个CAPs分子标记对12个品系的家蚕遗传多样性进行了初步研究,构建了其分子系统树。