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北京大学生物医学前沿创新中心高歌课题组在Nature Communications发表单细胞转录组数据检索新方法和参考数据库(图)
高歌 单细胞 转录组 数据检索新方法 参考数据库
2020/7/21
作为细胞异质性研究的重要工具,单细胞转录组测序技术近年来蓬勃发展,并积累了大量研究数据。若能有效利用现有的单细胞数据进行检索与推断,研究者便能更好地进行新测序单细胞的注释,以及综合多数据集的研究。然而,精确的单细胞转录组数据检索和注释需要克服两个挑战:一、数据集之间的批次效应(batch effect)会显著影响细胞检索的可靠性;二、目前缺少跨物种和平台、具有高质量注释的单细胞转录组数据库。日前,...

北京大学生物医学前沿创新中心张泽民课题组在Nature Communications发表单细胞类群纯度评估新方法(图)
北京大学生物医学前沿创新中心 张泽民 Nature Communications 单细胞 类群 纯度评估
2020/6/28
2020年6月22日,北京大学生物医学前沿创新中心(BIOPIC)、生命科学学院、北京未来基因诊断高精尖创新中心(ICG)、生命科学联合中心(CLS)张泽民实验室联合百奥智汇在期刊Nature Communications上发表了题为“An entropy-based metric for assessing the purityof single cell populations“的生物信息方法...