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基因组DNA是生命的蓝图，对基因组DNA实现任意尺度的精准操作代表对生命蓝图进行修改绘制的底层能力，是基因工程技术发展的核心。以CRISPR基因编辑技术为代表的技术进步实现了基因组单碱基和短序列尺度的精准编辑，基本解决了基因组精准编辑的挑战。然而，如何针对应用场景的需求，实现大片段DNA在基因组的高效精准整合，仍然是整个基因工程领域亟需突破的难题。该技术的突破意味着可以通过外源功能基因的精准写入来...
国家自然科学基金委员会中国学者在研究长链非编码RNA进化方面取得进展（图）
编码 进化 遗传
2024/8/29
在国家自然科学基金项目（批准号：32125007、32230018、91940302、32025007、T2288102、81827809）等资助下，清华大学张强锋团队和北京大学汪阳明团队、席建忠团队在鉴定同源长链非编码RNA（long non-coding RNA，lncRNA）研究方面取得进展，研究成果以“计算预测和实验验证鉴定人类和斑马鱼之间功能保守的长链非编码RNA（Computation...
中国科学院遗传发育所利用环状RNA开发出基于Cas12a的引导编辑器（图）
遗传发育 引导编辑器 基因
2024/1/12
基于CRISPR-Cas9的引导编辑器（prime editors，PEs）可同时实现任意碱基类型的精准替换，以及小片段的精准插入、替换和删除。目前，几乎所有的引导编辑器均是依赖于Cas9蛋白开发而成，但Cas9蛋白存在尺寸较大、脱靶效应高和受限于G/C-rich区域编辑的缺点，限制了引导编辑器的广泛应用。如何进一步提升引导编辑器的编辑精度、消除靶点序列限制并降低递送难度是基因组编辑领域亟待解决的...
2023年1月5日，上海科技大学生命科学与技术学院刘如娟教授与瑞典隆德大学Cristian Bellodi教授受邀在国际学术期刊Nature Reviews Molecular Cell Biology 在线发表了题为“Roles and regulation of tRNA-derived small RNAs in animals”的综述，总结了tRNA来源的小RNA(tRNA-derived...
中国科学院生物物理研究所专利：一种用于肝癌与肝癌微环境相互作用的新的长链非编码RNA检测及其应用
科学家开发时空转录组学并在亚细胞水平揭示RNA动力学图谱
时空转录组学 亚细胞水平 RNA动力学图谱
2024/1/16
细胞转录组的时空调节对细胞内蛋白质的正常表达及细胞功能至关重要。然而，由于现有转录组学方法不能同时获得时间和空间数据。美国麻省理工学院研究团队开发了时空转录组测序技术，并应用于探究RNA的生成、转运和降解速率，在亚细胞水平揭示RNA的动力学图谱。该研究成果于近日发表在《Nature Methods》上，题为：Spatiotemporally resolved transcriptomics rev...
第四届全国核糖核酸（RNA）青年学术会议在兰州大学成功举办（图）
核糖核酸 青年学术会议 兰州大学生命科学学院
2023/9/11
2023年4月20日上午，第四届全国核糖核酸（RNA）青年学术会议在兰州大学逸夫生物楼国锠报告厅开幕，开幕式由兰州大学生命科学学院侯岁稳院长主持并致辞。本次会议以“RNA研究新时代-前沿与健康”为主题，来自全国各地的350余名专家学者齐聚一堂，围绕“RNA生成代谢与调控功能、RNA与健康和农学、RNA修饰与表观遗传学以及RNA研究新技术和新方法”四个专题作了60余场精彩纷呈的学术报告及20余场墙报...
2023年4月12日，中国科学院北京生命科学研究院赵方庆团队在《自然-实验手册》（Nature Protocols）上，发表了题为Full-length circular RNA profiling by nanopore sequencing with CIRI-long的研究论文，建立了环形RNA全长转录本解析和高效挖掘的技术体系。
细胞自噬是一种溶酶体介导的降解途径，可以选择性清除胞内不需要的蛋白聚集体和受损的细胞器，以维持细胞稳态平衡。近年来的研究表明，通过液-液相分离（liquid-liquid phase separation, LLPS）形成的蛋白凝聚体在应激或者病理条件下发生异常的相转变，从而逃逸自噬降解。
宿主细胞依赖多种免疫应答机制来对抗病毒感染。其中，针对核酸分子的免疫识别和操作，是极为核心的抗病毒免疫策略，其广泛存在于从细菌到哺乳动物等几乎所有宿主系统中（图-1）。相较于哺乳动物细胞稍显复杂的信号转导和调控，细菌往往更为简单高效，其编码的多种抗病毒免疫系统可直接对核酸分子进行切割或修饰（图-1）。这种特点也使得细菌免疫系统被广泛用于多种生物学工具的开发（如R-M和CRISPR-Cas等），极大...
2023年1月30日，中国科学院生物物理研究所范祖森课题组在《The EMBO JOURNAL》杂志在线发表了题为"Noncoding RNA circBtnl1 suppresses self-renewal of intestinal stem cells via disruption of Atf4 mRNA stability"的文章，该研究揭示了在肠道干细胞高表达的环状RNA circB...
哮喘是儿童最常见的慢性呼吸道疾病，近年来，其发病率呈快速上升的趋势，国内1990-2010年儿童哮喘的发病率从1.09%增至3.02%，20年增加了2.8倍。目前上海市儿童的哮喘发病率已超过8%，成为国内发病率最高的城市，严重影响着儿童的生长发育及身心健康。哮喘是一种是由遗传、环境和表观遗传学因素等相互作用而引起的一种免疫炎症性疾病。表观遗传学是不依赖于DNA序列变化而由染色质改变产生的可稳定遗传...
中国科学院微生物研究所向华/李明研究团队此前发现一类全新的可以护卫CRISPR-Cas的双RNA型毒素-抗毒素系统CreTA（Science, 2021），进一步研究发现CreTA起源于mini-CRISPR结构，但其重复序列repeat发生了高度退化（Nucleic Acids Res, 2021）。CreTA的repeat序列为何会发生这一退化，其进化驱动力是什么，科学家们尚不清楚。近日，李明...
分子遗传学前沿讲座：RNA structure, a hidden regulator in living cells（时间：2022年7月27日14:00）（图）
分子遗传学 前沿讲座 RNA结构 丁一倞
2023/4/9
分子遗传学前沿讲座：RNA structure, a hidden regulator in living cells（时间：2022年7月27日14:00）。
