搜索结果: 1-8 共查到“农学 RNA seq”相关记录8条 . 查询时间(0.046 秒)
为开发与草鱼生长性状相关的基因以及单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism，SNP)标记，本研究采用转录组测序技术(RNA sequencing，RNA-Seq)对草鱼快长组和慢长组的肝脏、肌肉和脑组织分别进行分析，共获得31 465万条高质量短读序(clean reads)，经组装得到34 147条拼接基因(unigene)，平均长度为1 060 bp，其中有...
基于RNA-seq 的香蕉枯萎病菌转录因子FoSwi6敲除突变体的转录组分析
Fusarium oxysporum f. sp. cubense race 4 MAPK 转录组 差异表达基因
2021/4/28
丝裂原活化蛋白激酶(Mitogen-activated Protein Kinase,MAPK)信号通路转录因子 FoSwi6 在调控香蕉枯萎病菌4号生理小种(Fusarium oxysporum f. sp. cubense race 4, Foc4)的生理特性和致病性方面发挥着重要作用。为解析转录因子 FoSwi6 的转录调控机制,本研究利用RNA-seq技术对该病菌野生型菌株和突变体ΔFoS...
杜梨根茎叶特异表达基因的RNA-Seq分析
杜梨 激素 生长素响应蛋白 RNA-Seq分析
2018/11/5
利用RNA-Seq技术，对杜梨根、茎、叶中特异表达的基因进行了筛选和分析，为探讨梨属植物生长发育及组织间功能差异的分子机制提供理论依据。研究结果表明，杜梨根、茎、叶中分别获得了19 443、19 567、17 876个表达基因，分别注释得到110、110、110个GO功能分类和56、55、65条KEGG代谢途径，主要涉及能量代谢、物质代谢和运输、激素调控、信号转导等多种生物学功能；其中在根、茎、叶...
基于RNA-Seq筛选鸭肠炎病毒感染鸭脾差异表达免疫相关基因
脾 差异表达 免疫相关基因
2017/4/1
为挖掘鸭肠炎病毒(duck enteritis virus，DEV)感染鸭的差异表达免疫相关基因，本研究以DEV GZ株经腿部肌肉接种50 d鸭后，于接种后66、90和114 h采集鸭脾组织样本，提取总RNA，通过高通量RNA-seq技术测序，应用GO和KEGG数据库进行比对注释，并采用荧光定量PCR对部分差异表达基因进行验证，结果显示：DEV接种66 h时鸭脾的差异表达基因有511个，参与免疫相...
RNA-seq转录组测序分析不同季节对槟榔江水牛精液品质的影响
RNA-seq 槟榔江水牛 差异表达基因 精液品质
2016/7/26
本研究旨在利用RNA-seq技术对不同季节槟榔江水牛全血mRNA进行分析，找出不同季节精液品质候选基因。选取5头生长状况相近的3~5岁槟榔江水牛，进行春、夏、秋、冬4个季节的精液品质（鲜精活力、精子畸形率、射精量、精子密度）检测。根据精液品质，选取差异极显著的春（BL）、夏（SBL）两个季节的水牛样品进行RNA-seq转录组测序分析。颈静脉采集全血，抽提mRNA并组内混合制样，利用RNA-seq技...
通过研究不同年龄和不同性别绒山羊背最长肌之间的差异表达基因，筛选影响绒山羊肉品质的候选基因。本研究基于RNA-Seq技术对4个绒山羊背最长肌的转录组进行高通量测序，在测序评估的基础上，对差异表达基因进行筛选、功能注释和富集分析。本研究通过CLC Genomics Workbench 6.0软件共找到263个候选基因，其中包含123个高表达有利基因和140个高表达有害基因。GO功能注释结果显示，高表...
棉花纤维发育早期RNA-Seq转录组分析
棉纤维发育早期 RNA-Seq qRT-PCR
2014/4/1
为了揭示棉花纤维发育早期基因表达变化情况，本研究以纤维长度存在显著差异的两个陆海回交近交系NMGA-062（32.58 mm）和NMGA-105（27.06 mm）为材料，利用Illumina HiSeqTM 2000对0、3 DPA（Days post anthesis）的胚珠及10 DPA的纤维进行RNA-Seq测序。六个文库进行拼接，共得到长度大于200 bp的Unigene 98464个，...