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水稻是宁夏地区主要粮食作物, 水稻种植也具有维持生态系统平衡, 防止土地荒漠化等重要的生态功能。而稻田土壤细菌是维持土壤生态功能的基础。但长期以来缺乏对干旱地区稻田土壤细菌多样性的认识。本研究采用非培养技术提取稻田土壤样品总DNA, 构建其16S rDNA克隆文库, 用PCR-RFLP分析进一步测序后聚类分析细菌群落的多样性。从稻田土样中分离获得了大于23 kb的DNA片段。PCR-RFLP共得到...
具有溶磷能力的相思根瘤菌16S rDNA 序列分析
相思根瘤菌 16SrDNA全序列测定 系统发育学分析
2009/5/19
为了测定具有溶磷能力的相思根瘤菌的16S rDNA 序列。在TY 培养基上将菌株培养至对数生长期, 以提取的总DNA 为模板, 采
用双向引物进行PCR 扩增, 对获得的目的产物进行纯化和测序。采用PHYLIP 软件中DNADIST 程序分析各菌株间的相似性, 采用
Clustal X 和Treeconw 软件获得菌株的系统发育树状图。系统发育学分析表明:G7-3 、G31-1-5 、G31-...
数值分类表明 ,分离自西北半干旱地区的 9株黄芪根瘤菌构成一个独立的表观群。在此基础上 ,进行了DNA同源性及 16 S r DNA全序列分析。 9株菌的 G +C mol%在 5 9.1～ 6 0 .3之间 ;群内 DNA同源性为 81.5 %～91.0 % ,大于 70 % ;中心菌株 SH2 90 B与各已知种模式菌株 DNA同源性在 10 .5 %～ 6 3.0 % ,小于 70 %。 S...
数值分类表明 ,分离自西北半干旱地区的 9株黄芪根瘤菌构成一个独立的表观群。在此基础上 ,进行了DNA同源性及 16 S r DNA全序列分析。 9株菌的 G +C mol%在 5 9.1～ 6 0 .3之间 ;群内 DNA同源性为 81.5 %～91.0 % ,大于 70 % ;中心菌株 SH2 90 B与各已知种模式菌株 DNA同源性在 10 .5 %～ 6 3.0 % ,小于 70 %。 S...