搜索结果: 1-15 共查到“水产学 转录”相关记录20条 . 查询时间(0.042 秒)
中华绒螯蟹MSTN基因同义突变对基因转录、翻译效率的影响
中华绒螯蟹 肌肉抑制素基因 同义突变 基因功能
2021/2/3
为分析同义突变对基因转录、翻译的影响，本研究应用定点突变、体外转录和过表达等方法对中华绒螯蟹MSTN (Es-MSTN)基因中发现的五个SNP同义突变位点：SNP1(T/C)、SNP2(T/C)、SNP3(T/C)、SNP4(A/G)、SNP5(T/G)，及其对应的12种基因型组合(GC、AT、1T、2T、3T、4A、5T、1C、2C、3C、4G、5G)进行了转录和翻译水平的研究。结果发现：12种...
盐度是影响鱼类各种生理活动的重要环境因素，为探讨盐度急性胁迫对经济海水鱼类日本黄姑鱼基因表达水平的影响，本研究基于Illumina HiSeqTM 2500高通量测序平台，对不同盐度条件下日本黄姑鱼幼鱼肌肉组织进行转录组测序并开展生物信息学分析。高盐组、低盐组和对照组分别获得46 379 598、36 130 844和38 715 820条Clean reads，总碱基数分别为5.27、4.87和...
转录组测序筛选克氏原螯虾卵巢发育、免疫和生长相关基因
克氏原螯虾 转录组测序 差异表达基因 功能注释
2020/12/18
为发掘克氏原螯虾卵巢发育、免疫和肌肉生长的重要功能基因，采用Illumina HiSeqTM 2500高通量测序平台对克氏原螯虾的卵巢、肝胰腺和肌肉组织进行了转录组测序。所得序列经质控、组装后比对到NR、Swiss-Prot、pfam、COG、GO和KEGG数据库中注释，并进行差异基因聚类分析。结果显示，测序共获得了53 006个unigene，平均长度为1 194 bp。对3个组织样品的测序文库...
为探索赤眼鳟信号转导与转录激活因子1(signal transduction and activator of transcription 1, STAT1)的免疫功能，本研究利用cDNA末端快速扩增(RACE)技术获得了赤眼鳟STAT1基因(命名为ScSTAT1)，ScSTAT1基因的cDNA全长为2 922 bp，共编码718个氨基酸。ScSTAT1含STAT_int、STAT_alpha、S...
湖栖鳍虾虎鱼性腺转录组比较分析
湖栖鳍虾虎鱼 RNA-Seq 配子发生 繁殖
2021/3/3
为获得湖栖鳍虾虎鱼性腺基因表达谱，筛选性别决定、配子发生和繁殖相关基因，本研究对其卵巢和精巢分别进行了RNA-Seq分析。测序原始数据经de novo拼接组装共获得62 573个单基因(unigene)，N50和平均长度分别为3 082 bp和1 869 bp。在NR、NT、SwissProt、PFAM、KOG、GO及KEGG数据库中对上述获得的unigene进行注释，分别有41 480、32 8...
福瑞鲤2号不同生长速度个体肌肉组织转录组分析比较
鲤 转录组 肌肉生长 差异表达基因
2020/9/15
鲤鱼品种繁多，是世界上的重要经济鱼类。然而鱼类通过选育获得优良生长性状的遗传分子机制，目前尚不清楚。本研究分析比较了两种不同生长速度福瑞鲤2号肌肉组织的转录组文库。组装后共获得392, 238条测序序列(contigs)。其中可比对上斑马鱼、河豚、青鳉、三刺鱼、尼罗罗非鱼和松浦镜鲤的蛋白序列的比例为56.01% - 77.71%。两种不同生长速度福瑞鲤2号肌肉转录组比较，获得749个差异表达基因，...
为了深入了解引进溪红点鲑种质遗传结构状况，本研究利用溪红点鲑转录组数据设计四核苷酸重复微卫星引物1 018对，选择其中200对进行引物合成，经过筛选鉴定共获得111个特异性好且扩增效率高的微卫星标记，用其中27个多态性标记比较分析了溪红点鲑引进群体和养殖群体的遗传多样性。结果显示，27个微卫星位点在2个群体中共检测到171个等位基因，多态信息含量(PIC)为0.426 0~0.877 4，平均为0...
为了探究饲料不同脂肪水平对黄颡鱼卵巢脂肪代谢潜在的影响，本研究设计了活体与离体两个实验。活体实验中，分别投喂3组不同脂肪水平的饲料(脂肪含量分别为6.98%、11.34%和15.41%)8周。离体实验中，分离原代黄颡鱼卵母细胞，采用(0、0.2和0.5 mmol/L)3组不同脂肪酸浓度孵育48 h。活体实验结果显示：与6.98%和15.41%脂肪水平组相比，11.34%脂肪水平显著增加黄颡鱼卵巢甘...
温度胁迫对幼体大海马基因转录表达的影响
大海马 转录组测序 差异表达基因
2020/12/10
为探究大海马幼体在高温和低温胁迫条件下基因表达水平的变化规律,采用Illumina平台的PE150测序功能对大海马幼体肝脏进行了转录组测序。对照组、高温胁迫组和低温胁迫组测序数据组装后获得22 513个单基因簇(Unigene),N50为2 223 bp,平均长度为1 122.71 bp。与对照组相比,高温胁迫组共获得14 009个差异表达基因,其中5 543个差异表达基因上调,8 466个差异表...
为探索鱼类转铁蛋白基因tf 和转铁蛋白受体基因tfr1a的转录调控机制，本实验以团头鲂为研究对象，在其全基因组数据库中获取tf和tfr1a基因序列，对2个基因候选启动子区转录因子结合位点及CpG岛进行预测，通过PCR方法克隆得到tf和tfr1a基因近端启动子区不同长度片段，连接至pGL3-Basic/pEGFP-1载体，瞬时转染入Hela细胞，并采用双荧光素酶报告基因检测系统进行检测。结果发现，团...
中国水产科学研究院南海水产研究所热带水产研究开发中心“卵形鲳鯵转录因子GATA3/T-bet克隆及其抗细菌应答功能研究”等4个课题通过验收（图）
大珠母贝与南美白对虾池塘混养技术研究 卵形鲳鲹耐盐优良品系选育
2019/3/25
近日，三亚市科技工业信息化局组织专家对中国水产科学研究院南海水产研究所热带水产研究开发中心承担的三亚市院地项目“卵形鲳鯵转录因子GATA3/T-bet克隆及其抗细菌应答功能研究”等4个课题进行会议验收。验收专家组由来自三亚市南繁科学技术研究院、中科院深海科学与工程研究所、三亚市海洋与渔业监测中心、海南热带海洋学院、海南省海洋与渔业科学院等单位的专家组成。
龙须菜卤代烷烃脱卤酶基因的转录及原核表达
龙须菜 卤代烷烃脱卤酶 转录 原核表达
2020/1/10
卤代烷烃脱卤酶(HLD)是一类能降解卤代脂肪化合物的酶，为今后将藻类HLD用于环境中卤素化合物的降解提供资料，本实验利用生物信息学、荧光定量PCR和pET28a表达系统对大型红藻龙须菜中HLD的酶学特性、转录表达和原核表达进行了研究。生物信息学分析结果显示，龙须菜中HLD基因(记为GlHLD)开放阅读框长969 bp，理论分子量约为36.33 ku，等电点约为5.53；该GlHLD序列与绳状龙须菜...
为比较3个三角帆蚌（鹰蚌、超长蚌、纵纹蚌）育珠蚌选育群体（经过2代选育的鹰蚌、超长蚌、纵纹蚌）幼蚌之间的差异，于2014年和2015年分两次随机抽取同批繁殖且在同一池塘养殖的不同群体幼蚌各40只，测量其贝壳形态学、质量等生长性状指标。统计学分析结果表明，鹰蚌群体偏宽型，纵纹蚌群体偏高型，超长蚌偏长型；鹰蚌和纵纹蚌两个群体幼蚌在形态上更为相近；鹰蚌群体具明显壳宽和壳高生长优势，而超长蚌群体具明显壳长...
基于转录组测序技术筛选花䱻卵巢发育相关基因
花䱻 卵巢发育 转录组
2020/1/20
为筛选影响花䱻卵巢发育相关的基因，采用Illumina Hiseq技术对花䱻脑、卵巢和肝脏组织进行高通量转录组测序。结果显示，3个组织分别产生了49 484 132、47 540 538和50 622 304个clean reads，组装后共获得了99 878个unigenes，平均长度为1 430 bp。DE seq分析发现，在脑vs.卵巢组中特异性表达的基因数为2 ...